Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX1Q16384 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX1Q16384 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX1Q16384 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX1Q16384 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX1Q16384 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX1Q16384 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX1Q16384 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX1Q16384 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX1Q16384 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX1Q16384 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX1Q16384 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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