Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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