Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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