Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FOXD4Q12950 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FOXD4Q12950 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FOXD4Q12950 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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