Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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FOXC1Q12948 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXC1Q12948 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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FOXC1Q12948 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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