Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FOXF1Q12946 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FOXF1Q12946 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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FOXF1Q12946 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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