Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms