Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XPCQ01831 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XPCQ01831 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XPCQ01831 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPCQ01831 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPCQ01831 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms