Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms