Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB1P82279 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB1P82279 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRB1P82279 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CRB1P82279 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRB1P82279 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRB1P82279 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms