Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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UBE2NP61088 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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UBE2NP61088 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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UBE2NP61088 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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UBE2NP61088 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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UBE2NP61088 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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UBE2NP61088 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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