Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVPABLB-1P60509 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms