Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRPPRCP42704 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms