Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGM1P36871 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGM1P36871 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms