Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYF6P23409 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYF6P23409 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYF6P23409 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MYF6P23409 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYF6P23409 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYF6P23409 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYF6P23409 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYF6P23409 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYF6P23409 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms