Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRF1P14222 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRF1P14222 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRF1P14222 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms