Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms