Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPLO60437 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPLO60437 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPLO60437 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPLO60437 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PPLO60437 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPLO60437 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPLO60437 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms