Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms