Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PATL2C9JE40 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms