Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HMGB1P1B2RPK0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms