Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCP1A6NGW2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms