Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms