Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms