Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms