Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms