Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SLIRPQ9GZT3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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