Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms