Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNDC9Q8TBE3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms