Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFRP1Q8N474 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFRP1Q8N474 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms