Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMPD1Q5SYB0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms