Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBM48Q5RL73 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms