Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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RYR3Q15413 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RYR3Q15413 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RYR3Q15413 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RYR3Q15413 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RYR3Q15413 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RYR3Q15413 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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RYR3Q15413 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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RYR3Q15413 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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RYR3Q15413 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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RYR3Q15413 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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RYR3Q15413 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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