Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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