Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms