Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms