Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTR1BP42025 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms