Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms