Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF1P21675 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms