Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms