Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms