Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FZD3Q9NPG1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms