Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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CNTNAP3Q9BZ76 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CNTNAP3Q9BZ76 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNTNAP3Q9BZ76 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNTNAP3Q9BZ76 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNTNAP3Q9BZ76 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTNAP3Q9BZ76 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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