Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01662-202ENST00000611876 1559 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB18-202ENST00000375802 617 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001116.1-201ENST00000421604 762 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF9-204ENST00000425853 740 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092568.1-201ENST00000440950 1284 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSFX4-201ENST00000457775 1184 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A14P1-201ENST00000502867 901 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASGRF2-AS1-201ENST00000505107 665 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR5AC4P-201ENST00000509306 919 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00290-201ENST00000512487 593 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUPL2-212ENST00000548367 249 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002478.2-201ENST00000584060 557 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms