Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5DQ9BY66 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms