Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCD2Q9BXW9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms