Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms