Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP170Q5SW79 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms