Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms