Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms